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文献速递丨Naica数字PCR技术检测IDH2突变

提供者:北京深蓝云生物科技有限公司   发布时间:2019/12/20  阅读次数:67次   进入该公司展台

 文献速递丨Naica数字PCR技术检测IDH2突变
IDH2基因所编码的蛋白名为异柠檬酸脱氢酶2,人类IDH有三种类型,分别为IDH1、IDH2和IDH3,IDH1定位于细胞质和过氧化物酶体中,IDH2和IDH3定位于线粒体中。该类蛋白酶可以将异柠檬酸氧化为草酰琥珀酸,然后再转化为α-酮戊二酸。其中,IDH1/2是人类癌症中代谢基因发生突变频率最高的,并干扰细胞新陈代谢和表观遗传调控,从而促进肿瘤发生。在急性髓白血病中,IDH1/2突变与正常的核型,年龄及NPM1的突变有关,其中IDH2 R140Q突变最为常见。
近日,法国著名大学-巴黎萨克雷大学Gustave Roussy血液学系、生物与医学病理学系以及转化研究实验室等联合在德国Annals of Hematology上发表了一篇名为Spontaneous molecular response of IDH2 acute myeloid leukemia的文章。
研究报告了一例IDH2突变的急性髓细胞白血病(AML)患者,检测发现有61%的骨髓原始细胞。细胞遗传学揭示了其复杂的核型,二代测序分析显示IDH2 R140Q(突变频率28%)和KRASK117N(突变频率22%)突变。随后,研究人员再次对患者进行了骨髓抽吸,发现骨髓原始细胞从61%下降到17%,其中存在许多组织细胞和红细胞吞噬。进一步的细胞遗传学研究和NGS分析显示复杂的核型消失,但IDH2 R140Q突变减少(5%),BRAF突变持续存在(31%),表明克隆进化。
鉴于患者的身体状况不佳以及两次骨髓抽吸结果不一致,研究人员决定进行第三次骨髓抽吸。出乎意料的是,骨髓原始细胞小于5%,并伴随许多细胞吞噬。为了进一步验证该结果,研究人员通过使用法国Stilla Technologies的Naica 微滴芯片式数字PCR系统,对3个时间点的IDH2 R140Q突变进行了定量。结果如下图所示,和骨髓原始细胞的变化趋势一致,IDH2突变从28.15%急剧下降到2.32%。
 
急性髓白血病(AML)以不成熟髓细胞在骨髓里聚集,以及骨髓造血抑制为特征。AML的自发性完全缓解(SCR)是极其罕见的一种现象,目前关于其发生机制仍有待探讨。上述研究揭示了SCR与IDH2 R140Q的关系,并且IDH突变的评估可以通过数字PCR量化并与总生存期相关联。希望这一发现可以为急性髓白血病的治疗提供一个靶点和方向。
法国巴黎萨克雷大学(Université Paris-Saclay)合并了3所大学、4所大学校(Grande Ecole)与7个研究所,包括巴黎第十一大学、凡尔赛大学、中央理工-高等电力学院(CentraleSupélec)、高等光学学院、法国国家原子能研究所(CEA)、法国国家科学研究院(CNRS)等。在2019 US News世界大学排名中,位列全球第30名,欧洲大陆第2名,法国第1名。
Annals of Hematology:《血液学年鉴》,IF=2.85。涵盖了临床和实验血液学、止血学、输血以及肿瘤医学的相关领域,包括白血病、淋巴肿瘤和实体肿瘤的诊断和治疗,以及造血干细胞的移植。内容包括与人类血液病相关的肿瘤学、分子生物学和免疫学等方面。该杂志与德国血液学和医学肿瘤学协会,以及奥地利血液学和肿瘤学协会有联系。主编:阿诺德·甘瑟,德国汉诺威大学血液、止血和肿瘤学系。
该项研究使用了来自法国Stilla Technologies的Naica微滴芯片式数字PCR系统。
该系统利用cutting-edge微流体创新型芯片—Sapphire芯片作为数字PCR过程的唯一耗材。样品通过毛细通道网格以30,000个微滴的形式进入2D芯片中。并且还是首款3色荧光检测仪器,整个流程只需要两个半小时。结合强大的图像分析技术和直观可视的检测功能,从而达到了数字PCR定量卓越的置信水平,获得的数据真实可信。
三通道检测:兼容FAM, Evagreen /Cy3, VIC, HEX,/Cy5, Quasar® 705等染料,三色荧光检测,快速建立多重实验 ↓
 
微滴回溯:精确到单个微滴图像 ↓
简单操作,快速方便,全程只需2.5小时 ↓
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